生物经历
分子实验、组学分析，以及实验室之外的生态观察。
交叉项目见计算机经历：C10、Expression2Translation、PSPNet。
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Smc5/6 复合体 NSE2/NSE3 与基因组稳定性
2024.08–2024.12Georgia Tech · Kirill Lobachev 遗传学实验室
湿实验
针对重复 DNA 易形成异常结构并引发染色体重排的问题，以酿酒酵母构建 NSE2/NSE3 等位基因材料，为研究 Smc5/6 子单元的功能提供实验基础。
工作与方法：Smc5/6 复合体 NSE2/NSE3 与基因组稳定性
- 克隆与验证：参与 NSE2 基础克隆及小组 NSE3 扩展，完成目的片段扩增、pRS414 酶切连接、E. coli 转化和蓝白斑初筛；以酶切片段大小进一步核查构建，NSE3 初始扩增产物约 1,920 bp。
- 标记与诱变：通过重叠延伸 PCR 插入 URA3，结合 DpnI 去除亲本模板；在 NSE2 诱变条件中设置无锰对照及 160–480 μM MnCl2 梯度，比较诱变强度与扩增产量。
- 酵母筛选：采用 PEG/LiAc/单链 carrier DNA 路线完成酵母转化，设置诱变、非诱变和对照组，利用缺尿嘧啶培养条件及 1:10 稀释平板观察转化子生长。
- 测序解读：结合 Nanopore 克隆验证与扩增子报告检查 NSE3/URA3 构建；barcode06 组装长度 7,341 bp，1,500 条下采样 reads 的平均覆盖约 1,465×，将序列差异与构建质量一并整理。
分子克隆、PCR、酶切连接、重叠延伸 PCR、诱变 PCR、酵母转化、Nanopore
中国科学院遗传与发育生物学研究所动物设施
2024.05–2024.06实验室助理 · 北京
湿实验
参与抗原免疫与抗血清样本制备，衔接动物状态观察、血样处理与效价检测，为抗体材料的后续使用提供支持。
工作与方法：中国科学院遗传与发育生物学研究所动物设施
- 免疫与观察：将委托抗原与 Freund’s adjuvant 乳化用于免疫，跟踪多轮免疫中的动物状态，及时记录和报告异常。
- 样本与检测：参与血样采集和离心分离血清，准备 ELISA 效价检测所需样本，支持免疫效果评价与后续交付。
抗原乳化、实验动物观察、血样处理、血清分离、ELISA
校园生物多样性监测与评估
2024.01–2024.02Georgia Tech · 生态调查项目
生态调查数据可视化
以校园绿地和 Eco-commons 建筑群为场景，结合现场观察与历史资料分析物种组成及空间分布。
工作与方法：校园生物多样性监测与评估
- 生态数据分析：记录以鸟类为重点的脊椎动物观察，结合历史数据比较物种丰富度，绘制动植物相对丰度以呈现群落组成。
- 空间展示：使用 R leaflet 将观察位置匹配到校园地图，以颜色编码区分物种分布，把统计结果与空间场景结合。
R、leaflet、物种丰富度、相对丰度、空间可视化
北京郊区黑鹳种群与栖息地调查
2023.07北京林业大学研究项目 · 志愿者
生态调查
通过夏季种群观察、分布和栖息地威胁记录，为区域鸟类调查及保护资料汇总提供基础数据。
工作与方法：北京郊区黑鹳种群与栖息地调查
- 现场调查：参与北京郊区黑鹳数量、分布及栖息地调查，记录潜在威胁因素并整理观察信息。
- 数据汇报：将调查数据向北京市园林绿化局汇报，支持更大范围的地方鸟类数据整理。
野外观察、物种分布、栖息地调查、数据汇报
卵巢癌细胞干预响应的 RNA-seq 再分析
2022.09–2022.11Georgia Tech · 学生生物信息社团个人项目
生物信息数据可视化
分别分析 luteolin 与 bevacizumab/γ 辐照实验背景下的卵巢癌细胞转录响应，以各队列匹配对照识别差异表达及通路线索。
工作与方法：卵巢癌细胞干预响应的 RNA-seq 再分析
- 数据与质量控制：从 GEO 选择 GSE212598 与 GSE203044，共 12 个 RNA-seq 样本；分别设置 3 个处理与 3 个对照，使用 FastQC/MultiQC 检查数据并以 Kallisto 定量转录本。
- 差异分析：以 DESeq2 Wald 检验和 BH/FDR 处理约 3.08 万与 2.46 万个表达特征；按现存 adjusted p-value < 0.05 口径，两组分别筛得 11,675 和 5 个特征。
- 生物学解释：结合 PCA、层次聚类和 PANTHER/Reactome 分析细胞应激、周期与内质网应激相关响应，将 luteolin 数据中的表达分离与通路线索联系，区分队列内结论与跨细胞系比较。
RNA-seq、FastQC、MultiQC、Kallisto、DESeq2、R、BH/FDR、PCA、PANTHER、Reactome
人类外显子组分析与 OR4F5 变异解读
2022.10–2022.11个人项目
生物信息
围绕测序变异的功能优先级判断，实践比对与检测流程，并以示例注释结果连接人群频率、蛋白后果和结构模型。
工作与方法：人类外显子组分析与 OR4F5 变异解读
- 流程实践：针对公开 SRR077862 数据记录 BWA-MEM → SAMtools → BCFtools → VEP 分析链，完成 GRCh38 参考选择、读段比对尝试、比对整理与变异筛选方案。
- 注释与解释：基于示例 VEP 输出整理变异后果，选择 OR4F5 K104Q 错义变化，检索 dbSNP/UniProt 及相关文献，综合氨基酸变化、人群频率与功能预测组织解释。
- 结构比较：将 AlphaFold 野生型结构与 SWISS-MODEL 变异序列模型结合，定位第 104 位氨基酸，比较局部位置和模型置信度，形成结构可视化与分析报告。
BWA-MEM、SAMtools、BCFtools、VEP、GRCh38、dbSNP、UniProt、AlphaFold、SWISS-MODEL
彩蛱蝶翅形态的 CRISPR/Cas9 功能研究
2021.09–2021.12Georgia Tech · 本科遗传学Honor实验课题
湿实验数据可视化
以 Vanessa cardui 的翅色和眼斑为可观察表型，研究 optix、Distal-less 与 WntA 的扰动与形态变化之间的关系。
工作与方法：彩蛱蝶翅形态的 CRISPR/Cas9 功能研究
- 靶点与体外检查：使用 BLAST、CHOPCHOP 和 Primer-BLAST 辅助候选基因、sgRNA 与引物分析；完成 PCR 和 Cas9 体外检测，以约 503 bp 的 optix 扩增片段及 2% 琼脂糖凝胶核查实验产物。
- 注射与表型记录：参与胚胎显微注射及发育跟踪，按组别、注射日期和个体编号归档成虫，固定四片翅摆放顺序并拍摄背腹两面，记录颜色、对称性和眼斑特征。
- 定量与统计：用 ImageJ 测量翅部 ROI 与黑色面积比例，结合 R 分析班级汇总的 241 个观测记录；完成处理组/野生型比较，并结合腹面眼斑观察讨论单一面积指标的解释范围。
CRISPR/Cas9、BLAST、CHOPCHOP、Primer-BLAST、PCR、电泳、显微注射、ImageJ、R
